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Enregistrement W2340510833 · doi:10.1039/9781849734936-00190

Making Sense of Catalysis: The Potential of DNAzymes as Biosensors

2012· book-chapter· en· W2340510833 sur OpenAlexaff
Simon A. McManus, Kha Tram, Y. Li

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeoxyribozymeBiosensorAptamerCombinatorial chemistryNanotechnologyChemistryDNAAnalyteNucleic acidBiophysicsBiochemistryMaterials scienceBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA, long known as a carrier of genetic information, has recently revealed itself as a multifunctional entity. Using the powerful technique of in vitro selection, catalytic DNA molecules, known as DNAzymes or deoxyribozymes, have been isolated to catalyse numerous reactions using a range of metal-ion cofactors. Conjugation of these DNAzymes to an array of signalling platforms has led to the development of several DNAzyme-based sensor systems. By labelling DNAzymes and their nucleic acid substrates with fluorescent and quenching dyes, sensors have been designed to report the presence and concentration of specific metal ions with high sensitivity and specificity. By coupling DNAzyme activity to the aggregation state of gold nanoparticles, visual sensors have been designed that report the presence of a metal ion by a change in colour, eliminating the need for expensive detection equipment. Electrode-bound DNAzymes have been developed into electrochemical sensors offering high sensitivity and reduced background. The types of analyte that can be detected by DNAzymes have also been expanded by coupling DNAzymes to DNA aptamers that bind specific target molecules. These conjugates, called DNA aptazymes, have been developed to detect small molecules such as adenosine and adenosine triphosphate (ATP). Using an in vitro selection protocol with counter-selection steps, aptazymes that can detect molecules in complex mixtures have been isolated. This chapter will highlight innovative research that has been done to engineer DNAzyme-based sensors and discuss the prospects for using DNAzymes in future detection systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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