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Enregistrement W2340996397 · doi:10.18632/oncotarget.8924

The pro-apoptotic paradox: the BH3-only protein Bcl-2 interacting killer (Bik) is prognostic for unfavorable outcomes in breast cancer

2016· article· en· W2340996397 sur OpenAlexafffundabout
Vrajesh Pandya, Darryl Glubrecht, Larissa J. Vos, John Hanson, Sambasivarao Damaraju, John R. Mackey, Judith Hugh, Ing Swie Goping

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Innovates - Health SolutionsPfizer
Mots-clésBreast cancerApoptosisMedicineCancerCancer researchOncologyImmunologyInternal medicineBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Vrajesh Pandya 1 , Darryl Glubrecht 2 , Larissa Vos 2 , John Hanson 2 , Sambasivarao Damaraju 3 , John Mackey 2 , Judith Hugh 3 , Ing Swie Goping 1, 2 1 Department of Biochemistry, University of Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2H7, Canada 2 Department of Oncology, University of Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2H7, Canada 3 Laboratory Medicine and Pathology, University of Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2H7, Canada Correspondence to: Ing Swie Goping, e-mail: igoping@ualberta.ca Keywords: breast cancer, BH3-only proteins, Bcl-2 interacting killer, BiK, autophagy Received: March 02, 2016     Accepted: April 10, 2016     Published: April 22, 2016 ABSTRACT Breast cancer is the leading cause of cancer-associated deaths in women worldwide. Clinical biomarkers give information on disease progression and identify relevant biological pathways. A confounding factor that uncouples markers from disease outcome is the ability of tumor cells to mutate and evade clinical intervention. Therefore, we focussed on apoptotic genes that modulate tumor regression. Using gene and tissue microarray analyses, we identified an association of Bcl-2 interacting killer (Bik) with poor breast cancer prognosis. Bik prognostic ability was independent of Estrogen Receptor/Progesterone Receptor and Her2 status. Additionally, Bik was independent of anti-apoptotic Bcl-2, Bcl-xL, Mcl-1 and Bcl-w suggesting a complex mechanism of tumor promotion identified by Bik high tumors. Bik also stimulates autophagy, which can contribute to enhanced tumor fitness. We found a significant association between the autophagy marker ATG5 and Bik. Combined high expression level of ATG5 and Bik was a stronger predictor of outcome than either alone. Thus, our study identifies Bik as a novel, independent prognostic biomarker for poor outcomes in breast cancer and suggests that Bik-mediated autophagy contributes to disease recurrence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,587
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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