Invasive Group A Streptococcal Infections in Ontario, Canada: 1992–2013
Notice bibliographique
Résumé
Background. Invasive Group A streptococcal (iGAS) infections continue to cause significant morbidity and mortality. We explored trends in incidence, M-type, disease presentation, outcome, and antimicrobial resistance of iGAS infections in Ontario, Canada over a 22-year period. Methods. TIBDN has performed a prospective, population-based surveillance for all iGAS infections in metropolitan Toronto and Peel regions in Ontario, Canada since 1 January 1992. Clinical information was collected from health care providers. M typing was performed from January 1992 to September 2006 and emm typing from October 2006 to December 2013. Results. Overall, 2282 episodes of iGAS were identified; 1074 in the “former” cohort (1992-2002) and 1212 in the “recent” cohort (2003-2013). The average incidence per 100,000 residents was 2.7 in the former cohort and 2.8 in the recent cohort (p = 0.69). For each cohort, the most common clinical presentation was skin and soft-tissue infections, 47.8% and 43.3%. The percentage of cases of streptococcal toxic shock syndrome increased from 15.6% of patients in the former cohort to 19.3% in recent cohort (p = 0.08), while cases of necrotizing fasciitis decreased from 8.4% to 6.1% (p = 0.02). Case fatality rates declined over time, from 16.8% in 1992-5 to 13.6% in 2010-13 (p = 0.06). Both nosocomial and nursing home-associated infections declined significantly from 12.9% to 8.3% (p = 0.01) and 7.4% to 4.2% (p = 0.009), respectively. M serotype distribution varied substantially from year to year (M3 from 0 to 19.7%, M1 from 7.4-37%) but remained stable over each cohort, with the exception of the emergence of M89 in the recent cohort. M1 was consistently the most common and exhibited a four to five year cyclical pattern. Erythromycin resistance increased from 2.2% in 1992-1995 to 19.5% in 2008-2010, then declined to 7.5% in 2013. Conclusion. The overall incidence of iGAS remains unchanged over 22 years. The proportion of hospital and nursing home-associated cases has decreased, as have case fatality rates. M1 infections have a 4-5 year periodicity, M89 has emerged, and erythromycin resistance has varied significantly over time. An effective vaccine will be required to substantially reduce iGAS morbidity and mortality. Disclosures. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».