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Enregistrement W2341417211 · doi:10.1111/his.12989

Immunophenotypic features of dedifferentiated endometrial carcinoma – insights from <scp>BRG</scp>1/<scp>INI</scp>1‐deficient tumours

2016· article· en· W2341417211 sur OpenAlexafffund
Lien Hoang, Yow‐Shan Lee, Anthony N. Karnezis, Basile Tessier‐Cloutier, Noorah Almandani, Mackenzie Coatham, C. Blake Gilks, Robert A. Soslow, Colin J.R. Stewart, Martin Köbel, Cheng‐Han Lee

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensRoyal Alexandra HospitalCalgary Laboratory ServicesUniversity of CalgaryUniversity of AlbertaVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteAlberta Cancer FoundationRoyal Alexandra Hospital FoundationCancer Research SocietyCalgary Laboratory Services
Mots-clésCarcinomaPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Dedifferentiated endometrial carcinoma (DDEC) is defined by the presence of an undifferentiated carcinoma together with an endometrioid carcinoma. Inactivation of SMARCA4 (BRG1) and inactivation of SMARCB1 (INI1) were recently described as potential mechanisms underlying the histological dedifferentiation. The aim of this study was to characterize the immunophenotypic features of DDECs, particularly in cases with prototypical histological and molecular features (BRG1/INI1 deficiency). METHODS AND RESULTS: We evaluated PAX8, oestrogen receptor (ER) and p53 immunostaining in the endometrioid and the undifferentiated components of 20 BRG1/INI1-deficient DDECs and 15 BRG1/INI1-intact DDECs, and compared the results with those of 23 grade 3 endometrioid carcinomas. The differentiated endometrioid component was positive for PAX8 and/or ER in 19 of 20 BRG1/INI1-deficient DDECs, whereas the corresponding undifferentiated component of all 20 tumours showed a complete absence of PAX8 and ER staining. All except one of the BRG1/INI1-deficient tumours showed a wild-type p53 staining pattern. PAX8 and ER expression in the undifferentiated component was absent in 67% and 80% of BRG1/INI1-intact DDECs, respectively, whereas 47% of the BRG1/INI1-intact DDECs showed a mutated p53 staining pattern. In comparison, absent PAX8 expression and absent ER expression were each observed in the more solid area of 48% and 48% of grade 3 endometrioid carcinomas. CONCLUSIONS: The consistent absence of PAX8 and ER expression in molecularly defined (BRG1/INI1-deficient) DDECs suggests that the loss of PAX8 and ER expression is a fundamental feature of dedifferentiation. The frequent findings of a mutated p53 staining pattern in BRG1/INI1-intact DDECs indicate that BRG1/INI1-intact DDECs may be biologically different from BRG1/INI1-deficient tumours.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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