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Enregistrement W2341613060 · doi:10.1107/s2053230x16004611

Co-crystal structures of the protein kinase haspin with bisubstrate inhibitors

2016· letter· en· W2341613060 sur OpenAlexfundno aff
Darja Lavõgina, Katrin Kestav, A. Chaikuad, Christina Heroven, Stefan Knapp, Asko Uri

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section F Structural Biology Communications · 2016
Typeletter
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistero dello Sviluppo EconomicoEesti TeadusagentuurOntario Ministry of Economic Development and InnovationGenome CanadaWellcome TrustGlaxoSmithKlinePfizerEli Lilly and Company
Mots-clésHistone H3Protein kinase AChemistryBiochemistryKinaseHistonePhosphorylationDocking (animal)Binding siteProtein kinase inhibitorCell biologyDNABiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Haspin is a mitotic protein kinase that is responsible for the phosphorylation of Thr3 of histone H3, thereby creating a recognition motif for docking of the chromosomal passenger complex that is crucial for the progression of cell division. Here, two high-resolution models of haspin with previously reported inhibitors consisting of an ATP analogue and a histone H3(1-7) peptide analogue are presented. The structures of the complexes confirm the bisubstrate character of the inhibitors by revealing the signature binding modes of the moieties targeting the ATP-binding site and the protein substrate-binding site of the kinase. This is the first structural model of a bisubstrate inhibitor targeting haspin. The presented structural data represent a model for the future development of more specific haspin inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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