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Enregistrement W2342114921 · doi:10.1152/ajpcell.2000.278.4.c651

Alternatively spliced isoforms of the rat eye sodium/calcium+potassium exchanger NCKX1

2000· article· en· W2342114921 sur OpenAlexafffund
Susan Poon, Stephen Leach, Xiaofang Li, Joseph E. Tucker, Paul P. M. Schnetkamp, Jonathan Lytton

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversity of CalgaryFondation pour la Recherche MédicaleAmerican Heart Association
Mots-clésMolecular biologySodium-calcium exchangerAlternative splicingExonNorthern blotMessenger RNABiologyExtracellularGene isoformCytoplasmCytosolSodiumBiochemistryChemistryGeneEnzymeIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have investigated the structure, function, and expression of the rat eye sodium/calcium+potassium exchanger NCKX1. The sequence of independent rat NCKX1 clones and the analysis of rat eye mRNA by RT-PCR revealed a region of alternative splicing that comprised four exons and encoded a stretch of 113 amino acids near the beginning of the large cytosolic loop. In comparison with other NCKX1 molecules and the rat NCKX2 protein, rat NCKX1 was highly conserved within the hydrophobic regions but was quite divergent in the two large hydrophilic loops. The only exception was the region of the cytosolic loop encoded by the second alternatively spliced exon, which was approximately 60% identical. Similar to bovine, but different from human, rat NCKX1 possessed an acidic motif that was repeated 14 times in the cytoplasmic loop. Analysis of NCKX1 expression in different rat tissues by Northern blot revealed a very high level of expression of a 7-kb transcript in the eye but also lower levels of transcripts of various lengths in other tissues. The recombinant rat NCKX1 protein was tagged in the extracellular loop with the FLAG epitope and expressed in HEK-293 cells. Surface delivery and potassium-dependent sodium/calcium exchange activity were observed for each spliced variant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,672

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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