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Enregistrement W2342456077 · doi:10.1099/ijsem.0.001122

Lawsonella clevelandensis gen. nov., sp. nov., a new member of the suborder Corynebacterineae isolated from human abscesses

2016· article· en· W2342456077 sur OpenAlexaff
Melissa E. Bell, Kathryn Bernard, Susan M. Harrington, Nisha B. Patel, Trudy-Ann Tucker, Maureen G. Metcalfe, John R. McQuiston

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInfections and bacterial resistance
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMuramic acid16S ribosomal RNAMicrobiologyPeptidoglycanChemotaxonomyBacteriaGalactosePhylogenetic treeDiamino acidFatty acidCell wallBiochemistryTaxonomy (biology)GeneGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gram-stain-positive, partially acid-fast, non-spore-forming, anaerobic, catalase-positive, pleomorphic bacteria were isolated from human abscesses. Strains X1036T, X1698 and NML 120705, were recovered from a spinal abscess, a peritoneal abscess and a breast abscess respectively. A phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences showed that the strains shared 100 % similarity, and the nearest phylogenetic neighbour was Dietzia timorensis DSM 45568T (95%). Chemotaxonomic characteristics of the strains were consistent with those described for members of the suborder Corynebacterineae. Mycolic acids were detected using HPLC and one-dimensional TLC; whole-cell hydrolysates yielded meso-diaminopimelic acid with arabinose and galactose as the predominant sugars; the muramic acid acyl type was acetylated; the major menaquinone was MK-9 (96.3%); polar lipids detected were phosphatidylglycerol, phosphatidylinositol and an unknown glycophospholipid. Cellular fatty acids were hexadecanoic acid (C16 : 0), octadecenoic acid (C18 : 1ω9c) and decanoic acid (C10 : 0). Tuberculostearic acid was not detected. Based on the results of this polyphasic study, we conclude that these strains represent a novel genus and species within the suborder Corynebacterineae for which we propose the name Lawsonella clevelandensis gen. nov., sp. nov., with the type strain X1036T (=DSM 45743T=CCUG 66657T).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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