New Insights Into Shiga Toxigenic<i>Escherichia coli</i>Pathogenesis: When Less Is More
Notice bibliographique
Résumé
(See the major article by Russo et al on pages 1271–9.) Hemorrhagic colitis due to Shiga toxin–producing Escherichia coli (STEC) is perhaps the most feared foodborne infection in the industrialized world. The Centers for Disease Control estimates that there are 265 000 cases of STEC infection in the United States each year [1]. Whereas hemorrhagic colitis is a painful and often severe illness, the greatest concern with STEC infections is hemolytic-uremic syndrome (HUS), which develops in 5%–10% of patients and can cause permanent and occasionally fatal renal or neurologic sequelae. Some of the greatest frustrations with STEC infections are the lack of demonstrated effectiveness of antibiotics or other targeted treatments and their well-demonstrated ability to cause outbreaks because of contamination of seemingly innocuous foods (like sprouts, ready-to-eat salads, and tree nuts), in addition to ground beef, where these infections were first identified. The first reported serotype of STEC, and still the most common cause of hemorrhagic colitis and HUS, is O157:H7. Most O157:H7 isolates carry a specific complement of virulence factors within a locus of enterocyte effacement (LEE). The proteins encoded on the LEE allow O157:H7 to adhere intimately to intestinal epithelial cells and produce cytoskeletal changes in the cells, which greatly enhance its pathogenicity. However, the deadliest virulence factors of O157:H7 are its Shiga toxins, Stx1 and Stx2 (formerly called Shiga-like toxins). For E. coli to be called EHEC, it must possess the LEE and Stx1 and/or Stx2; those that express Stx1 and/or Stx2 without the LEE are referred to as STEC. In general, it is believed that non-EHEC STEC are less virulent than O157:H7, but some (like the O104:H4 enteroaggregative STEC that caused a large European outbreak in 2011) have alternative virulence factors that lead to severe illness [2].
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,004 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,019 | 0,027 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».