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Enregistrement W2343616226 · doi:10.1128/mbio.00465-16

Deletion of a Yci1 Domain Protein of Candida albicans Allows Homothallic Mating in <i>MTL</i> Heterozygous Cells

2016· article· en· W2343616226 sur OpenAlexafffund
Yuan Sun, Christine Gadoury, Matthew P. Hirakawa, Richard J. Bennett, Doreen Harcus, Anne Marcil, Malcolm Whiteway

Notice bibliographique

RevuemBio · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteConcordia University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchConcordia UniversityBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésMating typeBiologyMating of yeastHomothallismCandida albicansGeneticsLocus (genetics)MatingMutantCorpus albicansGeneMicrobiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: It has been proposed that the ancestral fungus was mating competent and homothallic. However, many mating-competent fungi were initially classified as asexual because their mating capacity was hidden behind layers of regulation. For efficient in vitro mating, the essentially obligate diploid ascomycete pathogen Candida albicans has to change its mating type locus from heterozygous MTLa/α to homozygous MTLa/a or MTLα/α and then undergo an environmentally controlled epigenetic switch to the mating-competent opaque form. These requirements greatly reduce the potential for C. albicans mating. Deletion of the Yci1 domain gene OFR1 bypasses the need for C. albicans cells to change the mating type locus from heterozygous to homozygous prior to switching to the opaque form and mating and allows homothallic mating of MTL heterozygous strains. This bypass is carbon source dependent and does not occur when cells are grown on glucose. Transcriptional profiling of ofr1 mutant cells shows that in addition to regulating cell type and mating circuitry, Ofr1 is needed for proper regulation of histone and chitin biosynthesis gene expression. It appears that OFR1 is a key regulator in C. albicans and functions in part to maintain the cryptic mating phenotype of the pathogen. IMPORTANCE: Candida albicans is a human fungal pathogen with a recently discovered, highly cryptic mating ability. For efficient mating, it has to lose heterozygosity at its mating type locus. Then, MTL homozygous strains can undergo an epigenetic switch to an elongated yeast state, termed the opaque form, and become mating competent. This infrequent two-step process greatly reduces the potential for mating; few strains are MTL homozygous, and the opaque state is unstable at the temperature of the mammalian host. C. albicans has a complex mechanism for mating that appears designed to ensure that mating is infrequent. Here, we have characterized a new gene, opaque-formation regulator 1 (OFR1). Deleting the OFR1 gene allows MTL A: /α strains to mate efficiently with either mating type or even mate homothallically. It is possible that downregulating OFR1 in the host environment could allow mating in C. albicans by a route that does not involve MTL homozygosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,284

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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