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Enregistrement W2343938190 · doi:10.1109/tcbb.2016.2515582

A New Approach for Feature Selection from Microarray Data Based on Mutual Information

2016· article· en· W2343938190 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene expression and cancer classification
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésFeature selectionMutual informationComputer scienceData miningRelevance (law)Feature (linguistics)HeuristicArtificial intelligenceInteraction informationBoosting (machine learning)Machine learningPattern recognition (psychology)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutual information (MI) is a powerful concept for correlation-centric applications. It has been used for feature selection from microarray gene expression data in many works. One of the merits of MI is that, unlike many other heuristic methods, it is based on a mature theoretic foundation. When applied to microarray data, however, it faces some challenges. First, due to the large number of features (i.e., genes) present in microarray data, the true distributions for the expression values of some genes may be distorted by noise. Second, evaluating inter-group mutual information requires estimating multi-variate distributions, which is quite difficult if not impossible. To address these problems, in this paper, we propose a new MI-based feature selection approach for microarray data. Our approach relies on two strategies: one is relevance boosting, which requires a desirable feature to show substantially additional relevance with class labeling beyond the already selected features, the other is feature interaction enhancing, which probabilistically compensates for feature interaction missing from simple aggregation-based evaluation. We justify our approach from both theoretical perspective and experimental results. We use a synthetic dataset to show the statistical significance of the proposed strategies, and real-life datasets to show the improved performance of our approach over the existing methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,820
Score d'incertitude au seuil0,472

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle