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Enregistrement W2344434652 · doi:10.1371/journal.pgen.1006010

The MADD-3 LAMMER Kinase Interacts with a p38 MAP Kinase Pathway to Regulate the Display of the EVA-1 Guidance Receptor in Caenorhabditis elegans

2016· article· en· W2344434652 sur OpenAlexafffund
Serena Ann D'Souza, Luckshi Rajendran, Rachel Bagg, Louis Barbier, Derek M. van Pel, Houtan Moshiri, Peter J. Roy

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCaenorhabditis elegansBiologyRabCell biologyGenetic screenEndosomeMutantLysosomeGeneticsBiochemistryGeneGTPase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The proper display of transmembrane receptors on the leading edge of migrating cells and cell extensions is essential for their response to guidance cues. We previously discovered that MADD-4, which is an ADAMTSL secreted by motor neurons in Caenorhabditis elegans, interacts with an UNC-40/EVA-1 co-receptor complex on muscles to attract plasma membrane extensions called muscle arms. In nematodes, the muscle arm termini harbor the post-synaptic elements of the neuromuscular junction. Through a forward genetic screen for mutants with disrupted muscle arm extension, we discovered that a LAMMER kinase, which we call MADD-3, is required for the proper display of the EVA-1 receptor on the muscle's plasma membrane. Without MADD-3, EVA-1 levels decrease concomitantly with a reduction of the late-endosomal marker RAB-7. Through a genetic suppressor screen, we found that the levels of EVA-1 and RAB-7 can be restored in madd-3 mutants by eliminating the function of a p38 MAP kinase pathway. We also found that EVA-1 and RAB-7 will accumulate in madd-3 mutants upon disrupting CUP-5, which is a mucolipin ortholog required for proper lysosome function. Together, our data suggests that the MADD-3 LAMMER kinase antagonizes the p38-mediated endosomal trafficking of EVA-1 to the lysosome. In this way, MADD-3 ensures that sufficient levels of EVA-1 are present to guide muscle arm extension towards the source of the MADD-4 guidance cue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,531

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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