Disruption of mesodermal enhancers for<i>Igf2</i>in the minute mutant
Notice bibliographique
Résumé
The radiation-induced mutation minute (Mnt) in the mouse leads to intrauterine growth retardation with paternal transmission and has been linked to the distal chromosome 7 cluster of imprinted genes. We show that the mutation is an inversion, whose breakpoint distal to H19 disrupts and thus identifies an enhancer for Igf2 expression in skeletal muscle and tongue, and separates the gene from other mesodermal and extra-embryonic enhancers. Paternal transmission of Mnt leads to drastic downregulation of Igf2 transcripts in all mesodermal tissues and the placenta. Maternal transmission leads to methylation of the H19 differentially methylated region (DMR) and silencing of H19, showing that elements 3' of H19 can modify the maternal imprint. Methylation of the maternal DMR leads to biallelic expression of Igf2 in endodermal tissues and foetal overgrowth, demonstrating that methylation in vivo can open the chromatin boundary upstream of H19. Our work shows that most known enhancers for Igf2 are located 3' of H19 and establishes an important genetic paradigm for the inheritance of complex regulatory mutations in imprinted gene clusters.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».