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Enregistrement W2345541934 · doi:10.4049/jimmunol.1600374

Phase-Variable Heptose I Glycan Extensions Modulate Efficacy of 2C7 Vaccine Antibody Directed against <i>Neisseria gonorrhoeae</i> Lipooligosaccharide

2016· article· en· W2345541934 sur OpenAlexaff
Srinjoy Chakraborti, Lisa A. Lewis, Andrew D. Cox, Frank St. Michael, Jianjun Li, Peter A. Rice, Sanjay Ram

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeHeptoseGlycanMicrobiologyGonorrheaNeisseriaAntibodyChemistryVirologyBiologyBacteriaImmunologyGlycoproteinBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neisseria gonorrhoeae, the causative agent of the sexually transmitted infection, gonorrhea, has developed resistance to most conventional antibiotics. Safe and effective vaccines against gonorrhea are needed urgently. A candidate vaccine that targets a lipooligosaccharide (LOS) epitope recognized mAb 2C7 attenuates gonococcal burden in the mouse vaginal colonization model. Glycan extensions from the LOS core heptoses (HepI and HepII) are controlled by phase-variable LOS glycosyltransferase (lgt) genes; we sought to define how HepI glycan extensions affect mAb 2C7 function. Isogenic gonococcal mutants in which the lgt required for mAb 2C7 reactivity (lgtG) was genetically locked on and the lgt loci required for HepI variation (lgtA, lgtC, and lgtD) were genetically locked on or off in different combinations were created. We observed 100% complement-dependent killing by mAb 2C7 of a mutant that expressed lactose (Gal-Glc) from HepI, whereas a mutant that expressed Gal-Gal-Glc-HepI fully resisted killing (>100% survival). Mutants that elaborated 4- (Gal-GlcNAc-Gal-Glc-HepI) and 5-glycan (GalNAc-Gal-GlcNAc-Gal-Glc-HepI) structures displayed intermediate phenotypes (<50% killing with 2 μg/ml and >95% killing with 4 μg/ml mAb 2C7). The contrasting phenotypes of the lactose-HepI and the Gal-Gal-Glc-HepI LOS structures were recapitulated with phase variants of a recently isolated clinical strain. Despite lack of killing of the Gal-Gal-Glc-HepI mutants, mAb 2C7 deposited sufficient C3 on these bacteria for opsonophagocytic killing by human neutrophils. In conclusion, mAb 2C7 showed functional activity against all gonococcal HepI LOS structures defined by various lgtA/C/D on/off combinations, thereby providing further impetus for use of the 2C7 epitope in a gonococcal vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,866

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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