CSN6, a subunit of the COP9 signalosome, is involved in early response to iron deficiency in Oryza sativa
Notice bibliographique
Résumé
The COP9 signalosome (CSN) plays an important role in proteasome-mediated degradation by regulating CUL1 rubylation of the SCF ligase and is involved in many crucial biological processes. Here, we demonstrate a link between IDEF1 accumulation and the decline in COP9 derubylation activity in response to iron deficiency (-Fe) in rice (Oryza sativa). CSN6 expression is rapidly down-regulated during Fe depletion, contributing to reduced CSN activity, as judged by CSN5 and CUL1 expression, indicating CSN6 is involved in the early stage response of -Fe. In contrast to CSN6, the IDEF1 protein and expression of several iron uptake/utilisation-related genes are increased in response to -Fe. Thus, we constructed CSN6 transgenic sense and antisense lines and found that experimental depletion of CSN6 results in accumulation of the IDEF1 protein and up-regulation of several iron uptake/utilisation-related genes. Furthermore, IDEF1 can be decorated with K48-linked polyubiquitin and degraded via the 26S proteasome. Accumulated IDEF1 in antisense lines led to increased chlorophyll and Fe content in seedlings during -Fe. Collectively, the cellular CSN6 level is decreased during early stages of -Fe to ensure the rapid accumulation of IDEF1, which in turn up-regulates several iron uptake/utilisation-related genes to help overcome -Fe stress in rice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».