BMET-31DEVELOPMENT AND APPLICATION OF A NOVEL MODEL OF HUMAN LUNG-TO-BRAIN METASTASIS TO IDENTIFY UNIQUE METASTATIC GENE SIGNATURES
Notice bibliographique
Résumé
Brain Metastases (BM) are the most common type of cerebral tumor in adult, occurring at a rate 10 times greater than that of primary brain cancers. The inherent abilities of a primary tumor cell capable of initiating a BM resembles that of a cancer stem cell (CSCs). Previous work conducted in our lab identified a population of CSCs within lung-derived brain metastases. We hypothesize that a subgroup of CSCs, termed brain metastasis-initiating cells (BMICs), are responsible for the initiation of BM and are identifiable by an exclusive subset of genes that regulate self-renewal and metastasis. Despite the prevalence and lethality of BM, there is no clinically relevant model that fully reflects metastasis in patients. We recently generated a novel human-mouse xenotransplantation model of BM that allows for interrogation of each phase of the metastatic process from lung to brain, through injection of human patient-derived GFP-expressing BMICs into immunocompromised mice via three routes: 1) intracranial (IC), 2) intrathoracic (IT) and 3) intravascular/intracardiac (IV). GFP+ cells were harvested from the lungs and/or brains from each injection route, and RNA was submitted for microarray analysis to identify a unique metastatic and tissue-specific gene signature. In order to identify genes involved in self-renewal and tumor initiation, we also performed RNA interference screens in vitro and in vivo on BMIC lines against 150 genes implicated in BM formation. Further in vitro validation of select hit genes identified SPOCK1 and TWIST2 as essential regulators of cell proliferation, sphere formation, and migration. Future work will validate the role of these genes in our established in vivo metastasis models. We also aim to examine their expression in primary lung FFPE samples to determine if they are predictive biomarkers of lung-to-brain metastasis in prospective cohorts of newly diagnosed lung cancer patients, and to determine their potential as therapeutic targets.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».