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Enregistrement W2346114808 · doi:10.1152/physiolgenomics.00112.2014

Responses of the mammary transcriptome of dairy cows to altered photoperiod during late gestation

2015· article· en· W2346114808 sur OpenAlexaff
Paul A. Bentley, E.H. Wall, G.E. Dahl, T.B. McFadden

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesUniversity of Illinois at Urbana-Champaign
Mots-clésBiologyLactationphotoperiodismEndocrinologyTranscriptomeInternal medicineMammary glandGene expressionGeneImmune systemAndrologyGeneticsPregnancyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cows exposed to short day photoperiod (SD, 8L:16D) during the 60-day nonlactating period prior to parturition produce more milk in their subsequent lactation compared with cows exposed to long day photoperiod (LD, 16L:8D). Although this response is well established in dairy cows, the underlying mechanisms are not understood. We hypothesized that differential gene expression in cows exposed to SD or LD photoperiods during the dry period could be used to identify the functional basis for the subsequent increase in milk production during lactation. Pregnant, multiparous cows were maintained on an SD or LD photoperiod for 60 days prior to parturition. Mammary biopsies were obtained on days -24 and -9 relative to parturition and Affymetrix GeneChip Bovine Genome Arrays were used to quantify gene expression. Sixty-four genes were differentially expressed (P ≤ 0.05 and fold-change ≥ |1.5|) between SD and LD treatments. Many of these genes were associated with cell growth and proliferation, or immune function. Ingenuity Pathway Analysis predicted upstream regulators to include TNF, TGF-β1, interferon-γ, and several interleukins. In addition, expression of 125 genes was significantly different between day -24 and day -9; those genes were associated with milk component metabolism and immune function. The interaction of photoperiod and time affected 32 genes associated with insulin-like growth factor I signaling. Genes differentially expressed in response to photoperiod were associated with mammary development and immune function consistent with the enhancement of milk yield in the ensuing lactation. Our results provide insight into the mechanisms by which photoperiod affects the mammary gland and subsequently lactation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,836
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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