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Enregistrement W2346325740 · doi:10.1159/000446024

Novel Genetic Loci Associated with the Plasma Triglyceride Response to an Omega-3 Fatty Acid Supplementation

2016· article· en· W2346325740 sur OpenAlexafffund
Bastien Vallée Marcotte, Hubert Cormier, Frédéric Guénard, Iwona Rudkowska, Simone Lemieux, Patrick Couture, Marie‐Claude Vohl

Notice bibliographique

RevueLifestyle Genomics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFatty Acid Research and Health
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismTriglycerideDocosahexaenoic acidEicosapentaenoic acidFish oilGenotypeGenome-wide association studyBiologyFatty acidInternal medicineEndocrinologyPolyunsaturated fatty acidGeneticsGeneCholesterolMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<b><i>Background:</i></b> A recent genome-wide association study (GWAS) by our group identified 13 loci associated with the plasma triglyceride (TG) response to omega-3 (n-3) fatty acid (FA) supplementation. This study aimed to test whether single-nucleotide polymorphisms (SNPs) within the <i>IQCJ, NXPH1, PHF17</i> and <i>MYB</i> genes are associated with the plasma TG response to an n-3 FA supplementation. <b><i>Methods:</i></b> A total of 208 subjects followed a 6-week n-3 FA supplementation of 5 g/day of fish oil (1.9-2.2 g of eicosapentaenoic acid and 1.1 g of docosahexaenoic acid). Measurements of plasma lipids were made before and after the supplementation. Sixty-seven tagged SNPs were selected to increase the density of markers near GWAS hits. <b><i>Results:</i></b> In a repeated model, independent effects of the genotype and the gene-supplementation interaction were associated with plasma TG. Genotype effects were observed with two SNPs of <i>NXPH1</i>, and gene-diet interactions were observed with ten SNPs of <i>IQCJ</i>, four SNPs of <i>NXPH1</i> and three SNPs of <i>MYB</i>. Positive and negative responders showed different genotype frequencies with nine SNPs of <i>IQCJ</i>, two SNPs of <i>NXPH1</i> and two SNPs of <i>MYB</i>. <b><i>Conclusion:</i></b> Fine mapping in GWAS-associated loci allowed the identification of SNPs partly explaining the large interindividual variability observed in plasma TG levels in response to an n-3 FA supplementation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,436
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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