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Enregistrement W2347080879 · doi:10.1038/nm.4089

Facilitating a culture of responsible and effective sharing of cancer genome data

2016· article· en· W2347080879 sur OpenAlexaff
Lillian L. Siu, Mark Lawler, David Haussler, Bartha Maria Knoppers, Jeremy Lewin, Daniël J. Vis, Rachel G. Liao, Fabrice André, Ian Banks, J. Carl Barrett, Carlos Caldas, Anamaria A. Camargo, Rebecca C. Fitzgerald, Mao Mao, John Mattison, William Pao, Patrick F. Sullivan, Bin Tean Teh, Robyn L. Ward, Jean C. Zenklusen, Charles L. Sawyers, Emile E. Voest

Notice bibliographique

RevueNature Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensOntario GenomicsMcGill UniversityPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKNational Human Genome Research InstituteHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésData sharingGenomic informationAllianceData scienceBig dataInformation sharingPrecision medicineComputer scienceProfiling (computer programming)GenomeComputational biologyBusinessBioinformaticsKnowledge managementMedicineBiologyPolitical scienceData miningGeneWorld Wide WebGeneticsAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,281
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,349
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,886

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2810,349
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0170,042
Communication savante0,0300,018
Science ouverte0,0060,044
Intégrité de la recherche0,0130,045
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,301
Tête enseignante GPT0,607
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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