MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2349856532 · doi:10.1107/s2053230x15024747

Crystal structure of microtubule affinity-regulating kinase 4 catalytic domain in complex with a pyrazolopyrimidine inhibitor

2016· article· en· W2349856532 sur OpenAlexfundno aff
John S. Sack, Mian Gao, Susan E. Kiefer, Joseph E. Myers, John A. Newitt, Sophie Wu, Chunhong Yan

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section F Structural Biology Communications · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Light SourceBristol-Myers Squibb
Mots-clésKinaseMicrotubuleSerineChemistryProtein kinase domainThreonineTransferasePhosphorylationCooperativityCell biologyBiochemistryBiologyBiophysicsEnzymeMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microtubule-associated protein/microtubule affinity-regulating kinase 4 (MARK4) is a serine/threonine kinase involved in the phosphorylation of MAP proteins that regulate microtubule dynamics. Abnormal activity of MARK4 has been proposed to contribute to neurofibrillary tangle formation in Alzheimer's disease. The crystal structure of the catalytic and ubiquitin-associated domains of MARK4 with a potent pyrazolopyrimidine inhibitor has been determined to 2.8 Å resolution with an Rwork of 22.8%. The overall structure of MARK4 is similar to those of the other known MARK isoforms. The inhibitor is located in the ATP-binding site, with the pyrazolopyrimidine group interacting with the inter-lobe hinge region while the aminocyclohexane moiety interacts with the catalytic loop and the DFG motif, forcing the activation loop out of the ATP-binding pocket.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,384
Score d'incertitude au seuil0,876

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueActa Crystallographica Section F Structural Biology CommunicationsMême sujetMicrotubule and mitosis dynamicsTravaux en français237 207