MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2351504912

[Antisense oligonucleotide inhibition of coxsackievirus B3 gene expression in HeLa cells and dose-response experiments].

2004· article· en· W2351504912 sur OpenAlexaff
Zhewei Liu, Hongmei Sun, Zonghui Xiao, Nan Qiu, Ting Zhang

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2004
Typearticle
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOligonucleotideMolecular biologyBiologyCoxsackievirusInternal ribosome entry siteMultiplicity of infectionCytopathic effectViral replicationTransfectionHeLaSense (electronics)VirologyMessenger RNAGeneVirusIn vitroTranslation (biology)ChemistryBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: In this study, the authors investigated inhibition of coxsackievirus B (CVB) gene expression using antisense oligonucleotides complementary to the 5' NCR, translation initiation codon and structural protein coding sequences and also observed the dose-response of the sequence specific inhibition of CVB plaque formation by antisense oligonucleotides. METHODS: Antiviral activities of these oligonucleotides were evaluated by using plaque reduction assay, yield reduction assay, cytopathic effect (CPE) and Western blot analysis. The cells were treated with random oligonucleotides as a specificity control. RESULTS: At a screening concentration of 5 micromole, 6 of the phosphorothioate oligonucleotide demonstrated some reduction of virus replication relative to untreated cells. 70%-90% inhibition of virus at 0.1 MOI (multiplicity of infection), 50% inhibition of virus infection at 10 MOI. The levels of the VP1 were reduced in CVB-infected cells treated with Scb561 and Scb733. VP1 was significantly reduced after treatment with 0.625 micromole Scb561 and almost undetectable in cells treated with 2.5 micromole Scb561. Dose response experiments implied that sequence specific oligonucleotide doses were related to effect on inhibition of CVB3 infection. When oligonucleotide doses were increased from 1.25 to 5 micromole, 75% to 90% inhibition were observed with Scb561 and 65% to 80% inhibition with Scb733, whereas random control failed to inhibit CVB replication (8% inhibition for each). CONCLUSION The present studies showed that antisense oligonucleotides against internal ribosome entry site (IRES) and translation initiation codon were capable of specifically inhibiting the synthesis of viral protein and subsequent productive CVB replication.The selective inhibition using antisense oligonucleotide might lead to development of an effective antiviral agent for future clinical evaluation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePubMed→Travaux en français237 207→