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Enregistrement W2351509964

Genetic diversity in Avena based on AFLP analysis

2008· article· en· W2351509964 sur OpenAlexaboutno aff
Guiqin Zhao

Notice bibliographique

RevueActa Pratacultural Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFood Quality and Safety Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmplified fragment length polymorphismUPGMAGenetic diversityAvenaGenetic distanceEcoRIBiologyGenetic relationshipGenetic variationGenetic similaritySimilarity (geometry)Jaccard indexBotanyGeneticsStatisticsRestriction enzymeMathematicsDNAGenePopulation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic diversity of 34 Avena sativa varieties and 8 A.nuda varieties from China,Canada,Australia,Europe and other countries was studied using amplified fragment length polymorphism(AFLP).Five primer pairs with higher polymorphic were selected from 30 EcoRI/MseI primers,268 AFLP markers were generated and 185 were polymorphic(69.0%).The highest polymorphic rate was 78.6% with primer E-AGG/M-CTA.In Nei's index calculation,the average variation coefficient was 0.166 4 and Shannon diversity index was 0.220 6.All cultivars Pairwise similarity coefficient varied from 0.488 1 to 0.988 0,with 0.012 0-0.717 2 genetic distance.The fingerprinting data were further analyzed using UPGMA methods which clustered the 42 varieties into six main distinct groups at 0.748 genetic similarity coefficients.A.sativa and A.nuda were divided into two groups at 0.59,which was in accordance with traditional classification.The genetic relationship revealed by AFLP was consistent with original sources;genetic distance was closely associated with geographical distributions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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