Sequence Analysis of the PB1 Polymerase Genes of H3 Subtype Duck Influenza Viruses
Notice bibliographique
Résumé
Objective Aquatic birds are the natural reservoir of avian influenza viruses.There exists a close relationship between the avian and human influenza.There are frequent epidemics of H3 subtype influenza virus among humans and the surveillance show that the carrier rate of H3 subtype influenza virus in aquatic birds is comparatively high.Methods To illustrate the relationship of H3 subtype influenza virus with other subtypes,we carried out the sequence analysis of PB1 polymerase genes of three H3N8 subtype duck influenza virus strains isolated from the live bird markets.Results The results showed that the nucleotide homologies of PB1 gene among the 3 strains of duck virus isolates were 99.9%,and those with H9N2 subtype virus(DK/ST/2143/00) were 96.31%～96.44%,but those with H3N8 virus(Mal/Alberta/279/98) were 88.65%～88.79%.The phylogenetic analysis showed that the PB1 genes of these three isolates fell into the same cluster and belonged to the cluster of A/duck/Hong Kong/Y439-like H9N2 subtype avian influenza viruses,which demonstrated that the gene segments of the three H3N8 subtype viruses reassorted with H9N2 virus strains.Conclussion The present findings suggest that we should pay great attention to the reassortment among different subtypes avian influenza viruses in natural host and the new characteristics of the reassortants,such as the pathogenicity of H3N8 subtype duck influenza viruses to chickens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,011 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».