Electrophoretic and Mass Spectrometric Strategies for the Identification of Lipopolysaccharides and Immunodeterminants in Pathogenic Strains of Haemophilus influenzae; Application to Clinical Isolates
Notice bibliographique
Résumé
The application of capillary electrophoresis coupled to electrospray mass spectrometry (CE-ES-MS) for the analysis of complex lipopolysaccharides (LPS) is presented. Electrophoretic conditions conducive to both negative and positive ion detection were developed, and facilitated the separation of closely related glycoforms and isoforms from 0-deacylated LPS of different strains of Haemophilus influenzae. To aid the identification of specific functionalities and immunodeterminants of LPS such as pyrophosphoethanolamine, phosphocholine and N-acetyl neuraminic acid, a mixed scan function was used to promote the in-source formation of selected fragment ions under high orifice voltage conditions, while enabling the detection of multiply-charged ions using low orifice voltage. By using such scanning functions, trace levels of 0-deacylated LPS containing a single phosphocholine group were detected at an estimated level of 5% of the overall LPS population. The sensitivity and specificity of the mixed scan function also facilitated the identification of trace levels of sialylated LPS from isolates originally obtained from otitis media. The detection of positive ions from anionic O-deacylated LPS was made possible in CE-ES-MS experiments using ammonium acetate buffers, thereby enabling the structural characterization of oligosaccharide branching by on-line tandem mass spectrometry using a quadrupole/time-of-flight instrument. The combination of high resolution with high sensitivity mass spectrometric detection provided an efficient analytical tool for probing the subtle structural changes occurring in the diverse population of LPS from H. influenzae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».