Notice bibliographique
Résumé
Thesis (Ph.D.)--Georgetown University, 2011.; Includes bibliographical references.; Text (Electronic thesis) in PDF format. Candida albicans is usually present as a commensal of the mucosal surfaces of the gastrointestinal and urogenital tracts but it is a major cause of hospital-acquired infection in immunocompromised individuals. Candida spp. are the fourth most common cause of bloodstream infection. Moreover, the mortality rate of systemic candidiasis is very high due to the difficulty in diagnosis and treatment. Candida albicans is a polymorphic fungus that can change its morphology ranging from hyphae to yeast. The ability to switch between these morphologies is believed to be involved in the pathogenesis and virulence of this organism. The Candida albicans PHR1 (pH-regulated) gene is an alkali-expressed gene that encodes a 548 amino acid residue GPI-anchored cell surface glycoprotein. The deletion of PHR1 in C. albicans resulted in pH-conditional defects of cell morphology and virulence. The enzyme encoded by PHR1 is required for proper cross-linking of beta-1,3-glucans and beta-1,6-glucans in the cell wall. Both this enzyme and the cell wall itself are absent in host cells, which makes it an interesting target for new antifungal drug development.; We developed methods to study protein-protein interactions which combined protein cross-linking, Triton℗ʼX-114 extraction, ion exchange chromatography, 2 dimensional SDS-PAGE and mass spectrometry of an epitope tagged Phr1p that proved successful in analyzing interactions of membrane bound Phr1p. Therefore, these procedures might be useful for studying other membrane proteins. The results showed that the Phr1p forms a complex about double the size of Phr1p and mass spectrometry indicated that Phr1p was the only major component of this complex. Together this suggests that Phr1p forms a dimer. The dimer was enriched in the detergent-rich phase after Triton℗ʼX-114 extraction and phase separation, an observation consistent with the dimer retaining a hydrophobic GPI-anchor moiety. Western Blotting results showed about 25-60% of Phr1p was in a dimeric form which may indicate that the function of the dimeric form of Phr1p is distinct from that of the monomeric form.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».