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Enregistrement W2365877602 · doi:10.1002/jcb.25574

N‐Linked Glycosylation Is Required for Vacuolar H<sup>+</sup>‐ATPase (V‐ATPase) <i>a4</i> Subunit Stability, Assembly, and Cell Surface Expression

2016· article· en· W2365877602 sur OpenAlexafffund
Sally Esmail, Yeqi Yao, Norbert Kartner, Jing Li, Reinhart A.F. Reithmeier, Morris F. Manolson

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGlycosylationProtein subunitImmunoprecipitationBiologyHEK 293 cellsMolecular biologyGene isoformColocalizationTransfectionEndoglycosidaseN-linked glycosylationBiochemistryGlycoproteinCell biologyGlycanGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The a subunit is the largest of 14 different subunits that make up the V‐ATPase complex. In mammalian species this membrane protein has four paralogous isoforms, a1 – a4 . Clinically, a subunit isoforms are implicated in diverse diseases; however, little is known about their structure and function. The subunit has conserved, predicted N‐glycosylation sites, and the a3 isoform has been directly shown to be N‐glycosylated. Here we ask if human a4 (ATP6V0A4) is N‐glycosylated at the predicted site, Asn489. We transfected HEK 293 cells, using the pCDNA3.1 expression‐vector system, to express cDNA constructs of epitope‐tagged human a4 subunit, with or without mutations to eliminate the putative glycosylation site. Glycosylation was characterized also by treatment with endoglycosidases; expression and localization were assessed by immunoblotting and immunofluorescence. Endoglycosidase‐treated wild type (WT) a4 showed increased relative mobility on immunoblots, compared with untreated WT a4 . This relative mobility was identical to that of unglycosylated mutant a4 N489D , demonstrating that the a4 subunit is glycosylated. Cycloheximide pulse‐chase experiments showed that the unglycosylated subunit degraded at a higher rate than the N‐glycosylated form. Unglycosylated a4 was degraded mostly in the proteasomal pathway, but also, in part, through the lysosomal pathway. Immunofluorescence colocalization data showed that unglycosylated a4 was mostly retained in the ER, and that plasma membrane trafficking was defective. Co‐immunoprecipitation studies suggested that a4 N489D does not assemble with the V‐ATPase V 1 domain. Taken together, these data show that N‐glycosylation plays a crucial role in a4 stability, and in V‐ATPase assembly and trafficking to the plasma membrane. J. Cell. Biochem. 117: 2757–2768, 2016. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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