Comparison of Both Preparation Methods of PCR Templates of Genomic DNA from Actinobaceteria
Notice bibliographique
Résumé
[Objective]The aim was to compare the two preparation methods of PCR templates of genomic Dna from Actinobaceteria. [Method]16 strains of 8 genera separated and identified from saline soil of Langfang,Hexi,including Saccharothrix Ⅳ23-3-4,NocardioidesⅤ22-5-1,Promicromonospora Ⅸ5-4-3,Micromonospora Ⅱ23-4-1,Actinopolyspora Ⅳ8-2-5,Nocardiopsis Ⅱ8-4-3,Streptomonospora DA01305,Streptomyces golden groups DA03401,Streptomyces golden groups DA01408,Streptomyces blue groups DA09140,Streptomyces golden groups DA01308,Streptomyces ash,red and purple groups DA05213,Streptomyces blue groups DA11417,Streptomyces pink spore groups DA04401,Streptomyces ash,red and purple groups DA04402,Streptomyces ball spore groups DA04307。The liquid nitrogen grinding method and the TE boiling method was used to treat Actinobaceteria in order to explore the rapid preparation method of PCR template,and the PCR template was amplified of 16S rDNA,then PCR product was detected by electrophoresis. [Method]The results showed the two methods both got the clear objective band,while the TE boiling method simplified the PCR template preparation process of DNA from Actinobaceteria,so could be used to prepare the PCR template of high-throughput Actinobaceteria rapidly. [Conclusion] The study provides an effective method for repaid identification and systematic classification of large quantities of strains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».