[Typing of Listeria monocytogenes in import and export foods with PFGE].
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate the molecular type and genetic correlation of Listeria monocytogenes (LMO) isolated from imported and exported foods. METHODS: Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) standard method recommended by american PulseNet for typing LMO was applied. The chromosomal DNA of L. monocytogenes was digested by restriction enzyme Asc I and analyzed by PFGE. The PFGE patterns of L. monocytogenes strains isolated from different areas were compared by using BioNumberics software to analyze the similarity between strains. RESULTS: Twenty-four L. monocytogenes strains were grouped into 20 PFGE subtypes by the similarity of PFGE pattern ranged from 44.45% to 100%. Particularly, it was identified that there were three subtype strain groups, each group sharing with the same PFGE pattern, and the similarity reaching 100%: the first group including LMO16 from Canada, LMO18 from America and LMO13 from Denmark, the second group including LMO7 from Denmark and LMO22 from Shunde, and the third group including LMO21 from Guangzhou and LMO8 from Shanxi. CONCLUSION: Generally, much genetic diversity was shown in Listeria monocytogenes isolated from import and export foods, but the correlations among strains are existed to some extent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».