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Enregistrement W2368508865

Core Collection of a Representative Germplasm Population in Brassica napus

2008· article· en· W2368508865 sur OpenAlexaboutno aff
Jianyi Zhao

Notice bibliographique

RevueZhongguo nongye Kexue · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNitrogen and Sulfur Effects on Brassica
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermplasmGenetic diversityBiologyGenetic similarityRapeseedBrassicaGenetic distancePopulationGene poolGeneticsGenetic variationBiotechnologyGeneHorticultureBotanyDemography
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

【Objective】Investigating the genetic diversity and selecting core collection of rapeseed.【Method】According to previous researches, 500 accessions from Europe, Asia, Canada, Australia and China were divided into four groups based on their qualities, geographic regions and growth habits. A primary core collection of 87 accessions was sampled from each group in same proportion. EST-STS and SSR markers were applied to measure their genetic diversities, eliminate the genetic redundancy and evaluate diversity indices of molecular markers for developing core collection. Phenotypes of individual core gene pool were analyzed and compared. 【Result】 Under the same selection background, two types of marker showed similar polymorphism rate (39%-40%), and polymorphic fragments number. Cluster analysis divided the 87 accessions into two groups (Ⅰ, Ⅱ) at similarity coefficient of 0.65, further two subgroups from each group were generated, respectively. A core collection consisted of 78 accessions was constructed after eliminating genetic redundancy above 0.85 genetic similarity coefficients. 【Conclusion】The results indicated that EST-STS was economic, effective and functional marker with similar efficacy compared with normal SSRs. The genetic diversity and cluster analysis supported the classification of four groups in Brassica napus. 78 accessions retaining the most genetic diversity and structure could be utilized and preserved as core germplasm collection for 500 initial rapeseed resources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,246
Score d'incertitude au seuil0,608

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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