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Enregistrement W2370620986

Screening and identification of the differentially expressed genes in lymphocytes of patients with unstable angina

2004· article· en· W2370620986 sur OpenAlexaff
Liang Xue

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraditional Chinese Medicine Studies
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuppression subtractive hybridizationExpressed sequence tagDot blotComplementary DNABiologyUnstable anginaGeneMolecular biologyNorthern blotSouthern blotcDNA libraryGeneticsMedicineMyocardial infarctionInternal medicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To screen and identify the differential expressed genes in lymphocytes from patients with unstable angina, in order to explore the developing mechanism of unstable angina at the molecular level, and to get some clues for diagnoses and potential gene treatment. Methods Suppression subtractive hybridizations (SSH) were performed to screen the differentially expressed genes in lymphocyte RNA between the patients with unstable angina and stable angina. The obtained forward and reverse cDNA fragments were directly inserted into pGEM T Easy vector and transformed into E.coli 109; clones with inserted fragment were screened with blue and white screening and colony PCR. The obtained colony PCR products were spotted at the same position on the Hybond N+ membrane and performed dot blot hybridized with forward and reverse suppression products to further screen the differentially expressed genes. The obtained Expressed Sequence Tags (ESTs) were used as probes to perform Reverse Northern blot with forward and reverse suppression products. The obtained positive ESTs were sequenced and analyzed using BLAST (nr) at NCBI. Results The result of dot blot hybridization showed that 93 positive clones were obtained in unstable angina group; 112 positive clones were obtained in stable angina group. Reverse Northern blot hybridization showed that 12 positive ESTs were obtained in unstable angina group; 20 positive ESTs were obtained in stable angina group.5 positive ESTs in each group were randomly selected to be sequenced and analyzed using BLAST (nr) at NCBI, all of them are sequences of known genes. Conclusion All these ESTs were associated with the occurring and development of unstable angina.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,136

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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