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Enregistrement W2371172604 · doi:10.2310/6650.2005.x0004.447

448 CHARACTERIZATION OF SECRETED PROTEINS OF NON-O157:H7 ENTEROHEMORRHAGIC ESCHERICHIA COLI SEROTYPES AND THEIR USE IN BOVINE VACCINE STUDIES.

2006· article· en· W2371172604 sur OpenAlexaff
Inna Sekirov, Y. Li, Wanyin Deng, C. L. deHoog, B. Brett Finlay

Notice bibliographique

RevueJournal of Investigative Medicine · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerotypeMicrobiologyEscherichia coliPolyclonal antibodiesBiologyVirologyPathogenBlotMonoclonal antibodySerologyAntibodySalmonella entericaOutbreakGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Purpose</h3> Secreted proteins (SPs) of enterohemorrhagic <i>Escherichia coli</i> (EHEC), a diarrhegenic pathogen, are central to the infection process, accounting not only for EHEC9s ability to invade the host and evade host defense systems but also for many clinical manifestations of the disease. To learn more about EHEC pathogenesis, the SPs of various EHEC human and bovine isolates were studied. <h3>Methods</h3> SPs of all serotypes used in the study were analyzed by SDS-PAGE and Western blotting. Additionally, some SPs of EHEC O103:H2 were analyzed by mass spectrometry and sequenced. SPs of 5 common EHEC serotypes were concentrated by ultrafiltration for use in bovine vaccine studies. <h3>Results</h3> SPs of non-O157:H7 serotypes were found to be sufficiently dissimilar to prevent their recognition by monoclonal antibodies directed against O157:H7 SPs, with the exception of the SPs of O55:H7. Polyclonal antibodies directed against EHEC O157:H7 SPs detected the SPs of most other serotypes. O103:H2 Z2338 was completely sequenced and found to be 96% identical to O157:H7 Z2338; however, Z2149 of O103:H2, which was partially sequenced, was only 40% identical to its O157:H7 homologue. Both proteins were secreted in greater amounts by O103:H2 than by O157:H7. Western blotting of SP from different EHEC serotypes using sera of 2 convalescent patients from 2 different EHEC outbreaks demonstrated obvious variations in patients9 serological responses. SPs of five serotypes commonly implicated in EHEC outbreaks were prepared for future use in bovine vaccine trials. <h3>Conclusions</h3> These results demonstrate the heterogeneity of SPs of different EHEC serotypes and highlight the diversity in serotype composition of different EHEC outbreaks. They further our knowledge of EHEC SP arsenal and can play a role in the design of effective bovine and potentially human vaccines against EHEC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil0,512

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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