P53 point mutations in initial superficial bladder cancer occur only in tumors from current or recent cigarette smokers
Notice bibliographique
Résumé
Sequencing of p53 exons 5-8 was carried out on 51 initial superficial bladder tumors selected on the basis of high grade and/or p53 overexpression (immunohistochemistry without antigen retrieval). Fourteen point mutations in 13 tumors and one 21 bp deletion in another tumor were identified. In addition, a germ-line mutation corresponding to a previously described polymorphism was detected in exon 6, in two tumors. Mostly G-->A transitions (10) were found. Only three occurred at CpG sites, suggesting a major role for exogenous carcinogens in bladder tumorigenesis. Immunostaining for p53 and MDM2, using antigen retrieval, was carried out on the same tumors. A correlation was found between the percentage of p53-positive cells and the presence of p53 mutations (P = 0.005). No correlation was found between overexpression of p53 and MDM2 in this selected cohort of mostly high grade tumors. The presence of p53 mutations was also analyzed as a function of the smoking habits of the patients. A significant association was found between the presence of p53 point mutations and the number of years of smoking (P = 0.043). All patients with tumors carrying missense or nonsense p53 mutations had smoked for >/=30 years and if former smokers, had stopped for </=5 years. However, no correlation was found between the presence of p53 point mutations and the number of cigarettes smoked. The deletion mutation was the only one present in a tumor from a non-smoker. The data suggest that duration of exposure to carcinogens is the most critical factor in p53 mutagenesis in bladder cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».