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Enregistrement W2374969104 · doi:10.1093/carcin/21.1.101

P53 point mutations in initial superficial bladder cancer occur only in tumors from current or recent cigarette smokers

2000· article· en· W2374969104 sur OpenAlexaff
Hélène LaRue

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité LavalHôtel-Dieu de Québec
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésPoint mutationCarcinogenesisMissense mutationExonSilent mutationMedicineCancer researchCancerBladder cancerSingle-strand conformation polymorphismImmunostainingCarcinogenPathologyTumor suppressor geneNonsense mutationImmunohistochemistryMutationBiologyOncologyInternal medicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sequencing of p53 exons 5-8 was carried out on 51 initial superficial bladder tumors selected on the basis of high grade and/or p53 overexpression (immunohistochemistry without antigen retrieval). Fourteen point mutations in 13 tumors and one 21 bp deletion in another tumor were identified. In addition, a germ-line mutation corresponding to a previously described polymorphism was detected in exon 6, in two tumors. Mostly G-->A transitions (10) were found. Only three occurred at CpG sites, suggesting a major role for exogenous carcinogens in bladder tumorigenesis. Immunostaining for p53 and MDM2, using antigen retrieval, was carried out on the same tumors. A correlation was found between the percentage of p53-positive cells and the presence of p53 mutations (P = 0.005). No correlation was found between overexpression of p53 and MDM2 in this selected cohort of mostly high grade tumors. The presence of p53 mutations was also analyzed as a function of the smoking habits of the patients. A significant association was found between the presence of p53 point mutations and the number of years of smoking (P = 0.043). All patients with tumors carrying missense or nonsense p53 mutations had smoked for >/=30 years and if former smokers, had stopped for </=5 years. However, no correlation was found between the presence of p53 point mutations and the number of cigarettes smoked. The deletion mutation was the only one present in a tumor from a non-smoker. The data suggest that duration of exposure to carcinogens is the most critical factor in p53 mutagenesis in bladder cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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