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Enregistrement W2379957171 · doi:10.1186/s13104-016-2073-8

Impact of serotype and sequence type on the preferential aerosolization of Streptococcus suis

2016· article· en· W2379957171 sur OpenAlexafffund
Léa Gauthier-Levesque, Laetitia Bonifait, Nathalie Turgeon, Marc Veillette, Phillipa Perrott, Daniel Grenier, Caroline Duchaine

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensCentre de Recherche Industrielle du QuébecUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecFonds de Recherche du Québec - Santé
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de Montréal
Mots-clésStreptococcus suisAerosolizationSerotypeMicrobiologyVirulenceVirologyMultilocus sequence typingBiologyOutbreakPathogenGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Streptococcus suis is a swine pathogen that causes pneumonia, septicemia and meningitis. It is also an important zoonotic agent responsible of several outbreaks in China. S. suis strains are classified into 35 serotypes based on the composition of their polysaccharide capsule. S. suis serotype 2 causes the majority of severe infections in pigs and in human, and can be further subdivided into sequence types (STs) based on multilocus sequence typing. The ST1 is associated with highly virulent strains. In North America, the strains most commonly isolated belong to ST25 and ST28, which are respectively moderately and weakly virulent in a mouse model. The presence of S. suis bioaerosols in the air of swine confinement buildings has been previously demonstrated. The aim of this study was to better understand the aerosolization behaviour of S. suis by investigating the preferential aerosolization of various strains of S. suis, belonging to different serotypes or STs, using in-house developed environmental chamber and bubble-burst nebulizer. qPCR technology was used to analyze the ratio of S. suis strains. RESULTS: The results suggest that the highly virulent serotype 2 ST1 strains are preferentially aerosolized and that the S. suis preferential aerosolization is a strain-dependent process. CONCLUSION: These observations will need to be confirmed using a larger number of strains. This study is a proof of concept and increases our knowledge on the potential aerosol transmission of S. suis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,400
Tête enseignante GPT0,504
Écart entre enseignants0,104 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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