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Enregistrement W2380863703

Analyzing and predicting of the effect of Lactobacillus peptidoglycan on gene expression in immune cells of BALB/c mice immune cells using GO database

2008· article· en· W2380863703 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMachine Learning in Bioinformatics
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemPeptidoglycanBiologyGene expressionGeneImmunological synapseAntigen presentationLymphocyteInnate immune systemBALB/cImmunologyCell biologyMolecular biologyT cellMicrobiologyBiochemistryT-cell receptor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective:To explore the effect of Lactobacillus peptidoglycan (PGN) on gene expressing profile of murine immune cells.Methods:BALB/c mice were administrated (i.p.) with Lactobacillus peptidoglycan once or three times.Total RNA was extracted from pooled peritoneal macrophages and splenic lymphocytes.Affymetrix MOE430A genechip was used to analyze gene expression.Expression data was further analyzed using tools based on GO database (GoSufer,DAVID cluster analysis tool and GenMAPP).Significantly changed genes for their expressing amount was termed as PGN responsive genes.Results:1 dose of WPG administration triggered a rapid and widespread response in the expressing prifile.When treated thrice,a slow but more specific response was induced which was focused on immune response.PGN responsive genes were analyzed using GenMAPP,the results showd that PGN-representative biological process GO terms were related to macrophage phagocytic activity,lymphocyte activation functionation and positive regulation of inflammatory response.The GO terms related to molecule function were related to metabolism and signal transduction.The GO terms of cellular components were related to immunological synapse and T cell receptor complex.Conclusion:WPG mainly induceds the activations of innate immune response and enhanced antigen presentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,451

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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