Sequences Comparison and Phylogenetic Tree Analysis of 288 Strains of Porcine Circovirus
Notice bibliographique
Résumé
In order to know the heredity disciplinarian of porcine circovirus(pcv) and pave the basement for preventing and controlling the disease.In this research,nucleotide sequences of 26 strains of PCV1 and 262 strains of PCV2 were analyzed,also,the ORF1's and ORF2's nucleotide sequences and deduced amino acid sequences were analyzed.At the nucleotide level,the results show that PCV1sequences and PCV2 sequences were divided into two different branches,and among the PCV1 sequences there were no obvious regularity,but among PCV2 sequences,there were divided into two different sub-gene types.The sub-gene typeⅠwas mainly consisted of sequences from American,Canada and Australia,and the sub-gene typeⅡwas mainly consisted of sequences from Franch and Newzealand.At the amino acid level,the phylogenetic tree was very complexity,and there were no obvious regularity.It was found statistically that,although nearly ten years pasted, the sequences homology of PCV had no large changes,the results showed that PCV was very conserved.After analyzed the phylogenetic tree,we discovered that the distributing of PCV had no geographic and time restriction.Also,we analyzed the mutant dots of the PCV2 nucleotide sequences and deduced amino acid sequences,we discovered that,PCV2 nucleotide sequences were easy to has base transversion.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».