Completely Sequencing and Gene Organization of the Anser cygnoides Mitochondrial Genome
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondrial genome(mt DNA) has advantages in rapid evolution, rich polymorphism and maternally inheritance without gene recombinations, which has become an ideal molecular markers of population genetics, phylogenetics, molecular ecology and taxonomy. In this study, the primers were designed based on the mitochondrial genome sequence of Bean goose(Anser fabalis) which was a closely related species of Swan goose(Anser cygnoides). Swan goose mitochondrial genome sequence was analysed by direct sequencing techniques. The results showed that whole mitochondrial genome sequence was 16 739 bp(Gen Bank accession No. KJ124555) in Swan goose, including 22 t RNA genes, 2 r RNA genes, 13 proteincoding genes and a D-loop region. Base composition of T, C, A and G were 22.49%, 32.24%, 30.21% and15.06%, respectively. Besides, the base preference of AT was not determined. 22 kinds of t RNA were all typically cloverleaf structures. Compared to 12 Sr RNA of Red Junglefowl(Gallus gallus) and Mongolian Ground Jay(Podoces hendersoni), we found the secondary structure of 12 Sr RNA included 4 domains, 37 stemloops and 13 salients in the Swan goose, and LSP/HSP, ETAS1- 2, goose hairpin, E- box, F- box, D- box, Cbox, Bird similarity- box, CSB1- box, CSB- like and OH in the D- loop control region. Finally, taken Red Junglefowl as an outgroup, the phylogenetic tree was constructed based on mitochondrial genome sequences using Neighbor-joining(N-J) algorithm, Maxium-likelihood(ML) algorithm and Bayesian model. The results showed that Swan goose, Greylag goose, Bean goose, white- fronted goose and Canada goose had close genetic relationship. The findings enrich the ducks mitochondrial genome sequences and provide a theoretical basis for the study of geese phylogeny.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».