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Enregistrement W23920047 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.1037.12

Variants of 5‐lipoxygenase from human neutrophils impact on leukotriene biosynthesis in HEK293 cells

2008· article· en· W23920047 sur OpenAlexafffundabout
Luc H. Boudreau, Jonathan Bertin, Marc E. Surette

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueDelphi Technique in Research
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGene isoformTransfectionHEK 293 cellsAlternative splicingMolecular biologyExonMessenger RNAArachidonic acidBiosynthesisBiochemistryArachidonate 5-lipoxygenaseChemistryBiologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

5‐lipoxygenase (5‐LO) catalyzes the oxygenation of arachidonic acid and is an essential enzyme forleukotriene (LT) biosynthesis. Human neutrophils (PMN) are important producers of LTB 4 , a potent chemoattractant involved in the inflammatory response. In this study, we evaluated whether alternative forms of 5‐LO mRNA exist in human PMN and if they are implicated in the biosynthesis of LTB 4 . RT − PCR analysis of total mRNA from human PMN revealed several potential variants of 5‐LO mRNA. Molecular cloning and sequencing experiments showed that at least three isoforms are present in human PMN. One containing all 14 exons with the expected splicing sites (full 5‐LO) producing a known protein of 78 kDa. Another isoform retained intron 10 (alpha‐10) resulting in a shift of the open reading frame and produces a protein of expected molecular weight of 56 kDa. A third isoform lacked the first 96 nucleotides of exon 10 (delta‐p10) and produces a protein of expected molecular weight of 74 kDa. HEK293 cells transfected with the full 5‐LO produced LTB 4 and 5‐hydroxyeicosatetraenoic acid (5‐HETE) following ionophore stimulation; however, cells transfected with either alternative isoform produced no 5‐LO products. HEK293 cells transfected with the full 5‐LO and co‐transfected with the alpha‐10 or the delta‐p10 isoform produced 25±2% (mean±sem) and 49±7% (mean±sem) less 5‐LO products, respectively, compared to cells expressing only the full 5‐LO. These alternative isoforms of 5‐LO may represent a new mechanism for the regulation of LT biosynthesis in inflammatory cells. (Supported by the Canadian Institutes of Health Research and the Canada Research Chairs Program).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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