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Enregistrement W2395036760

Influence of human immunodeficiency virus type 1 envelope glycoprotein YXXL endocytosis/polarization signal on viral accessory protein functions.

2002· article· en· W2395036760 sur OpenAlexaff
Guillermo Cervantes-Acosta, Robert Lodge, Guy Lemay, EA Cohen

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycoproteinBiologyEndocytosisViral envelopeVirologyViral entryCell biologyHerpesvirus glycoprotein BViral proteinInfectivityTranscytosisVirusViral replicationMolecular biologyReceptorGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: A tyrosine-based targeting signal in the intracytoplasmic domain of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) envelope glycoprotein is required for basolateral targeting of viral budding in polarized epithelial cells, concentration of viral assembly at one pole of infected lymphocytes, and rapid endocytosis of the glycoprotein from the plasma membrane. In HIV-1, the process of viral assembly and budding is complex and involves the participation of viral accessory proteins. STUDY DESIGN/METHODS: In this study, we examined whether the functions of the Nef, Vif, and Vpu proteins can influence or be influenced by the presence of envelope targeting signal in epithelial cells or lymphocytes. A series of proviral DNAs combining a mutation that inactivates the targeting signal with independent mutations in the three accessory proteins was constructed for this purpose. RESULTS: It was found that none of these three accessory proteins affected the basolateral release of the virus in polarized MDCK cells. Reciprocally, a mutation abolishing targeting of the viral envelope glycoprotein did not affect the phenotype conferred by the accessory proteins. Interestingly, the mutation abolishing targeting increased viral infectivity only in the presence of the Vpu protein. This phenotype was found to be associated with the release-enhancing function of Vpu and with an increased incorporation of viral envelope glycoprotein in virions. CONCLUSIONS: These data clearly show that accessory protein functions, and more specifically Vpu modulation of viral infectivity, can be affected by variations in the viral envelope glycoprotein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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