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Enregistrement W2395271881 · doi:10.1002/prca.201500139

Protein translation occurs in platelet concentrates despite riboflavin/UV light pathogen inactivation treatment

2016· article· en· W2395271881 sur OpenAlexafffund
Peter Schubert, Brankica Culibrk, Simrath Karwal, Raymond P. Goodrich, Dana V. Devine

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS - CLINICAL APPLICATIONS · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood transfusion and management
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanada Foundation for Innovation
Mots-clésProteomeProteomicsPuromycinPlateletQuantitative proteomicsRiboflavinPathogenBiologyTranslation (biology)BiochemistryCell biologyProtein biosynthesisChemistryMessenger RNAImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Pathogen inactivation technologies (PITs) were introduced into blood banking to further improve the safety of blood products. However, the UV light used in PITs to terminate pathogen growth might alter the functionality of the cells in the blood product as well as the protein profile of the blood components. This study employed proteomic approaches to assess changes in the platelet proteome and translatome. EXPERIMENTAL DESIGN: Apheresis-derived platelet concentrates treated with riboflavin/UV light or untreated controls were analyzed throughout blood bank storage by quantitative proteomics using iTRAQ and puromycin-associated nascent chain (PUNCH) proteomics. RESULTS: Quantitative proteomic analysis identified 408 individual proteins including 26 unique proteins that changed in the treated arm during storage. Proteomic results were confirmed using immunoblot analyses and results suggested a translational control of the protein expression profile. PUNCH proteomic analysis of day 7 samples from illuminated units identified 52 unique platelet proteins that incorporated puromycin, including proteins involved in the cytoskeleton, metabolism, and signaling. CONCLUSION AND CLINICAL RELEVANCE: This study demonstrates for the first time that platelets can synthesize proteins despite the riboflavin and UV treatment and suggests that platelets may possess a mechanism to protect their mRNA from damage by the PI treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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