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Enregistrement W2395282506 · doi:10.1128/microbe.1.209.3

Real-Time PCR: Analyte-Specific Reagents versus FDA-Approved Kits

2006· article· en· W2395282506 sur OpenAlexaff
François J. Picard, Ann Huletsky, Gale Stewart, Maurice Boissinot, Michel G. Bergeron

Notice bibliographique

RevueMicrobe Magazine · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnalyteComputational biologyComputer scienceVirologyMedicineBiologyChromatographyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the January 2006 issue of the Clinical Microbiology Reviews, Espy et al. published a detailed comprehensive review on real-time PCR in clinical microbiology (M. J. Espy, J. R. Uhl, L. M. Sloan, S. P. Buckwalter, M. F. Jones, E. A. Vetter, J. D. C. Yao, N. L. Wengenack, J. E. Rosenblatt, F. R. Cockerill, and T. F. Smith, Clin. Microbiol. Rev. 19:165–256, 2006). This new technology is revolutionizing laboratory diagnosis of human pathogens. The authors covered extensively the literature on real-time PCR as well as the wide array of commercially available analyte-specific reagents (ASR) and products for research use only for real-time PCR but did not provide adequate coverage of available rapid real-time PCR diagnostic kits for detection of bacterial pathogens that are approved by the Food and Drug Administration (FDA). Currently, there are two FDA-approved real-time PCR kits that can replace standard culture (H. D. Davies, M. A. Miller, S. Faro, D. Gregson, S. C. Kehl, and J. A. Jordan, Clin. Infect. Dis. 39: 1129–1135, 2004; D. K. Warren, R. S. Liao, L. R. Merz, M. Eveland, and W. M. Dunne, J. Clin. Microbiol. 42:5578– 5581, 2004) and which are both commercialized by GeneOhm Sciences (a BD Company). The first, IDI-Strep BTM, was approved by the FDA in March 2003 for detection of group B streptococci from vaginal/anal swab specimens obtained from pregnant women during delivery (Davies et al., Clin. Infect. Dis. 39:1129–1135, 2004; F. J. Picard and M.G. Bergeron, Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 23:665–671, 2004). The second, IDIMRSATM, was approved in March 2004 for detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus from a nasal swab specimen (M. G. Bergeron, A. Huletsky, F. J. Picard, and M. Boissinot, Nature 430: 141, 2004; A. Huletsky, R. Giroux, V. Rossbach, M. Gagnon, M. Vaillancourt, M. Bernier, F. Gagnon, K. Truchon, M. Bastien, F. J. Picard, A. van Belkum, M. Ouellette, P. H. Roy, and M. G. Bergeron, J. Clin. Microbiol. 42:1875–1884; Warren et al., J. Clin. Microbiol. 42:5578– 5581, 2004).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,403
Score d'incertitude au seuil0,949

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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