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Enregistrement W2395284226 · doi:10.1021/jm5017895

Pyrimethamine Derivatives: Insight into Binding Mechanism and Improved Enhancement of Mutant β-<i>N</i>-acetylhexosaminidase Activity

2015· article· en· W2395284226 sur OpenAlexafffund
Michael B. Tropak, Jianmin Zhang, Sayuri Yonekawa, Brigitte Rigat, Virender S. Aulakh, Matthew R. Smith, Hee-Jong Hwang, Marco A. Ciufolini, Don J. Mahuran

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoCanada Research ChairsUniversity of British ColumbiaSickKids Foundation
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChemistryIC50StereochemistryPyrimethamineChlorine atomInhibitory postsynaptic potentialStructure–activity relationshipMutantToxicityIn vitroBiochemistryMedicinal chemistryOrganic chemistryChloroquine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to identify structural features of pyrimethamine (5-(4-chlorophenyl)-6-ethylpyrimidine-2,4-diamine) that contribute to its inhibitory activity (IC50 value) and chaperoning efficacy toward β-N-acetylhexosaminidase, derivatives of the compound were synthesized that differ at the positions bearing the amino, ethyl, and chloro groups. Whereas the amino groups proved to be critical to its inhibitory activity, a variety of substitutions at the chloro position only increased its IC50 by 2-3-fold. Replacing the ethyl group at the 6-position with butyl or methyl groups increased IC50 more than 10-fold. Surprisingly, despite its higher IC50, a derivative lacking the chlorine atom in the para-position was found to enhance enzyme activity in live patient cells a further 25% at concentrations >100 μM, while showing less toxicity. These findings demonstrate the importance of the phenyl group in modulating the chaperoning efficacy and toxicity profile of the derivatives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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