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Enregistrement W2395372647 · doi:10.1093/jxb/erw187

WAX INDUCER1 (HvWIN1) transcription factor regulates free fatty acid biosynthetic genes to reinforce cuticle to resist Fusarium head blight in barley spikelets

2016· article· en· W2395372647 sur OpenAlexafffund
Arun Kumar, Kalenahalli Yogendra, Shailesh Karre, Ajjamada C. Kushalappa, Yves Dion, T. M. Choo

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaGrain Research CentreMcGill University
Organismes subventionnairesMinistère de l'Agriculture et de l'AlimentationMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Mots-clésCutinBiologyPathogenFusariumMyceliumCuticle (hair)GeneMicrobiologyPalmitic acidFatty acidBiochemistryBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB), caused by Fusarium graminearum, is one of the most devastating diseases of wheat and barley. Resistance to FHB is highly complex and quantitative in nature, and is most often classified as resistance to spikelet infection and resistance to spread of pathogen through the rachis. In the present study, a resistant (CI9831) and a susceptible (H106-371) two-row barley genotypes, with contrasting levels of spikelet resistance to FHB, pathogen or mock-inoculated, were profiled for metabolites based on liquid chromatography and high resolution mass spectrometry. The key resistance-related (RR) metabolites belonging to fatty acids, phenylpropanoids, flavonoids and terpenoid biosynthetic pathways were identified. The free fatty acids (FFAs) linoleic and palmitic acids were among the highest fold change RR induced (RRI) metabolites. These FFAs are deposited as cutin monomers and oligomers to reinforce the cuticle, which acts as a barrier to pathogen entry. Quantitative real-time PCR studies revealed higher expressions of KAS2, CYP86A2, CYP89A2, LACS2 and WAX INDUCER1 (HvWIN1) transcription factor in the pathogen-inoculated resistant genotype than in the susceptible genotype. Knockdown of HvWIN1 by virus-induced genes silencing (VIGS) in resistant genotype upon pathogen inoculation increased the disease severity and fungal biomass, and decreased the abundance of FFAs like linoleic and palmitic acids. Notably, the expression of CYP86A2, CYP89A2 and LAC2 genes was also suppressed, proving the link of HvWIN1 in regulating these genes in cuticle biosynthesis as a defense response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,879

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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