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Enregistrement W2395435909

In vitro binding characteristics and affinity for sulfatide of Escherichia coli STb enterotoxin.

2001· article· en· W2395435909 sur OpenAlexaff
Hans-Erick Beausoleil, J. Daniel Dubreuil

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnterotoxinToxinChemistryBiochemistryGalactoseSulfationBinding siteIn vitroCeramideEscherichia coli
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It has previously been demonstrated that sulfatide (3'-sulfogalactosyl-ceramide), present at the surface of epithelial cells of the small intestine of pigs, interacts with the thermostable enterotoxin b (STb) produced by ETEC, and that this molecule is implicated in the mechanism of action of the toxin. However, few things are known about the affinity and physical characteristics of the interaction between these two macromolecules. In this study, using a microtiter plate binding assay (MPBA), we showed that STb toxin has a strong specificity for sulfatide and that this binding is dose-dependent and saturable. A very weak binding occurred with galactosyl-ceramide whereas attachment to 3'-sulfolactosyl-ceramide corresponded to 76% of the binding to sulfatide. STb toxin was shown to possess a lectin-like property; a significative binding was observed when a terminal beta-galactose was present in the glycosphingolipids tested and an increased binding was observed in presence of a sulfate group in position 3 on the galactose. These findings suggest that a sulfated galactosyl residue seems to represent the epitope recognized by the toxin. The reaction between sulfatide and STb toxin is also time and temperature dependent and is not affected by pH. The interaction was not inhibited by free sugars, sulfated polymers, glycolipids or free ions, but was partly inhibited by high concentrations of charged sugars. STb-sulfatide binding process is a low affinity interaction, as demonstrated by the determined Kd of 2-6 +/- 1.5 microM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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