Abstract A34: BRCA1 and BRCA2 mutation spectrum across 5, 509 high-risk individuals identifies pathogenic variants associated with ethnicity, age of diagnosis, and type of cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Hereditary Breast and Ovarian Cancer Sydrome (HBOC) accounts for approximately 5-10% of breast and ovarian cancer cases and germline mutations of the BRCA1 and BRCA2 genes confer substantially increased risk. However, the risk of developing cancer, the type of cancer and the associated age at diagnosis vary depending on the type of mutation carried and the individual's ethnic background and gender. Screening of BRCA1 and BRCA2 mutations was conducted on 5, 512 high-risk individuals with a prior probability of carrying a pathogenic mutation (>10% chance) from the Advanced Molecular Diagnostics Laboratory (AMDL) (Mount Sinai Hospital, Toronto). Information on age, type of cancer diagnosed and age at diagnosis, ethnicity and family history were collected. Cumulative incidence competing risk and Fine-Gray proportional hazard regression analyses were generated to determine factors associated with earlier diagnosis of cancer. Among 5,029 women and 480 men who underwent testing, a total of 845 unique variants were identified of which, 289 (34.2%) are pathogenic. There were 603 female mutation carriers, of these, 303 were affected with breast or ovarian cancer (50%), 16 with another cancer (2.25%) and 284 were unaffected (47.1%). We also identified 20 different ethnic groups presenting with at least 3 unique variants. Six ethnic groups carried at least one variant associated with an earlier diagnosis of cancer and differential breast or ovarian cancer incidence. For instance, among the Ashkenazi Jewish cohort, the c.68_69del variant was associated with significantly earlier age at diagnosis for ovarian cancer incidence (Gray's test = 40.6; Fine-Gray HR = 1.12, 95% CI = 1.05 – 1.31). By screening a diverse cohort of high-risk individuals for BRCA1 and BRCA2 mutations, we identified pathogenic variants associated with an earlier age of diagnosis and differential incidence of breast or ovarian cancer among unique ethnic groups. Citation Format: Andrew H. Girgis, Marina Wang, Alexa Fine Kathleen-Rose ZakoorSam Khalouei, George Charames, Jordan Lerner-Ellis. BRCA1 and BRCA2 mutation spectrum across 5, 509 high-risk individuals identifies pathogenic variants associated with ethnicity, age of diagnosis, and type of cancer. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Advances in Breast Cancer Research; Oct 17-20, 2015; Bellevue, WA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2016;14(2_Suppl):Abstract nr A34.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».