Abstract A10: Oncogenomic analysis of IGF-IR driven mammary tumors identifies a potential cell of origin and mechanisms of tumor recurrence
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genetically engineered mice are valuable tools for understanding the genetic events that contribute to breast cancer development and progression. We have previously generated a doxycycline (Dox) inducible model of breast cancer, MTB-IGFIR, in which overexpression of the human type-I IGF receptor (IGF-IR) leads to the rapid induction of ER-mammary tumors with mixed luminal and basal features. Following Dox withdrawal and subsequent transgene downregulation, a subset of tumors escape IGF-IR dependence and spontaneously recur with evidence of an epithelial-mesenchymal transition (EMT). To gain insight into the molecular pathways that drive primary and recurrent tumor growth in MTB-IGFIR mice, we carried out gene expression profiling and DNA copy number analysis. Gene-set enrichment analysis (GSEA) revealed expression of an Akt oncogenic signature in primary tumors, consistent with downstream signaling mediated by IGF-IR. Interestingly, primary tumors also expressed a luminal progenitor gene signature suggesting a potential cell of origin. Accordingly, flow cytometric analysis of Dox-pulsed mice showed that high expression of the IGF-IR transgene was confined to EpCAM+/high Sca-1− cells, a putative ER- alveolar progenitor population. Recurrent tumors were found to express a mammary stem cell (MaSC) gene signature, which is consistent with their more mesenchymal phenotype as well as increased cell cycle pathway activity. While aCGH analysis identified few genomic changes in primary tumors, recurrent tumors exhibited gains and losses in known oncogenes and tumor suppressors including MET receptor, YAP1 and p16Ink4a/p19ARF. Integration of mRNA and copy number data confirmed altered expression of these genes at the transcriptional level. Taken together, these results suggest IGF-IR drives tumor initiation in an ER- luminal progenitor cell population in part through activation of the Akt pathway and that multiple genetic alterations contribute to the acquisition of oncogene independence and tumor relapse. Citation Format: Robert A. Jones, Craig I. Campbell, Katrina L. Watson, Roger A. Moorehead. Oncogenomic analysis of IGF-IR driven mammary tumors identifies a potential cell of origin and mechanisms of tumor recurrence. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Advances in Breast Cancer Research; Oct 17-20, 2015; Bellevue, WA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2016;14(2_Suppl):Abstract nr A10.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».