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Enregistrement W2396672421 · doi:10.1002/hep.28479

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2016· article· en· W2396672421 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueHepatology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Health and Medical Research CouncilNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteDepartment of Veterans' Affairs, Australian Government
Mots-clésHepcidinTransferrin saturationExome sequencingBiobankEthics committeeTransferrinGlycated haemoglobin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our work was supported, in part, by grant 1R24DK093433‐01 from the National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, grant P30 CA‐62203 from the National Cancer Institute, and funds from the Department of Veterans Affairs. This work was also supported, in part, by a Project Grant (APP1031325) from the National Health and Medical Research Council (NHMRC) of Australia (to V.N.S.). V.N.S., G.A.R., and G.J.A. are supported by Senior Research Fellowships from the NHMRC of Australia. Potential conflict of interest: Dr. Phatak consults for Novartis and Nektar. Dr. Adams received a grant from Gilead. Author names in bold designate shared co‐first authorship. We read with interest the report by Hsiao et al. that Taiwanese women not selected for iron phenotypes, who were hetero‐ or homozygous for the glyceronephosphate O‐acyltransferase (GNPAT) p.D519G (rs11558492) polymorphism, had higher serum iron levels than GNPAT wild‐type subjects. Women with GNPAT p.D519G also had higher levels of serum iron and transferrin saturation (TS) after a test dose of oral iron. Response to oral iron was not significantly different in Taiwanese women with or without TMPRSS6 rs855791, a polymorphism associated with reduced activity of the enzyme, matriptase‐2, an inhibitor of hepcidin transcription.1 Moreover, the association of GNPAT p.D519G with baseline serum iron levels was independent of TMPRSS6 rs855791, age, and amount of menstrual blood loss. In our exome sequencing study, GNPAT p.D519G was also associated with high‐iron phenotypes in Caucasian men with HFE p.C282Y homozygosity.2 The important results of Hsiao et al. provide further support for a role of GNPAT in the regulation of iron metabolism in a population in which HFE p.C282Y is rare. The allele frequency of GNPAT p.D519G in the Taiwanese cohort was 12%, similar to that in the general population of the 1000 Genomes Project (14%). Thus, GNPAT p.D519G is a relatively common determinant of the higher baseline serum iron levels and response of serum iron/TS measures to oral iron among Taiwanese women. In nonanemic young Caucasian women with hypoferritinemia, test doses of oral iron ≥60 mg increased circulating hepcidin levels and decreased fractional iron absorption on the subsequent day.3 Taken together, these observations suggest that GNPAT p.D519G alters hepcidin regulation and iron absorption in response to oral iron, although this is unproven. At present, there are no published observations of the possible effects of GNPAT p.D519G on hepcidin expression or iron absorption in Caucasian women with or without p.C282Y. In our article,2 we did not propose that GNPAT p.D519G is an “HFE modifier,” but rather that it is a modifier of iron status in HFE p.C282Y homozygotes. Hsiao et al. suggest that GNPAT p.D519G acts independently of HFE on hepcidin regulation, and their results indicated that the effect of the GNPAT p.D519G allele does not involve interaction with matriptase‐2. However, their observations do not exclude a possible interaction of GNPAT p.D519G with wild‐type HFE protein or any other upstream regulator of hepcidin transcription. We observed that small interfering RNA–mediated knockdown of GNPAT in HepG2/C3A cells markedly reduced HAMP messenger RNA expression, but had no demonstrable effect on the BMP/SMAD pathway.3 Thus, taken together, our results and those of Hsiao et al. are consistent with the possibilities that GNPAT p.D519G either affects a gene or genes upstream of HAMP or alters hepcidin expression directly. Elucidating GNPAT's putative role in regulating hepcidin requires further study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,144
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0050,006
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0090,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1440,090

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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