THBS2 Is a Candidate Modifier of Liver Disease Severity in Alagille Syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Background & Aims Alagille syndrome is an autosomal-dominant, multisystem disorder caused primarily by mutations in JAG1 , resulting in bile duct paucity, cholestasis, cardiac disease, and other features. Liver disease severity in Alagille syndrome is highly variable, however, factors influencing the hepatic phenotype are unknown. We hypothesized that genetic modifiers may contribute to the variable expressivity of this disorder. Methods We performed a genome-wide association study in a cohort of Caucasian subjects with known pathogenic JAG1 mutations, comparing patients with mild vs severe liver disease, followed by functional characterization of a candidate locus. Results We identified a locus that reached suggestive genome-level significance upstream of the thrombospondin 2 ( THBS2 ) gene. THBS2 codes for a secreted matricellular protein that regulates cell proliferation, apoptosis, and angiogenesis, and has been shown to affect Notch signaling. By using a reporter mouse line, we detected thrombospondin 2 expression in bile ducts and periportal regions of the mouse liver. Examination of Thbs2 -null mouse livers showed increased microvessels in the portal regions of adult mice. We also showed that thrombospondin 2 interacts with NOTCH1 and NOTCH2 and can inhibit JAG1–NOTCH2 interactions. Conclusions Based on the genome-wide association study results, thrombospondin 2 localization within bile ducts, and demonstration of interactions of thrombospondin 2 with JAG1 and NOTCH2, we propose that changes in thrombospondin 2 expression may further perturb JAG1–NOTCH2 signaling in patients harboring a JAG1 mutation and lead to a more severe liver phenotype. These results implicate THBS2 as a plausible candidate genetic modifier of liver disease severity in Alagille syndrome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».