Abstract P1-01-04: Early stage breast cancer prognostication using whole tumor or Ki67 heterogeneity-based digital imaging
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Accurate prognosis of hormone-positive early stage breast cancer patients offers the opportunity to make more informed follow-up choices, for example the addition of adjuvant chemotherapy. More recently patient prognostication based on immunohistochemistry-scored protein expression (ER, PR, Her2 and Ki67) in the ATAC trial has been described as IHC4 (C-index of 0.78). However, IHC4 clinical translation has not occurred and may be hindered by the need for a clinically-validated standardized assay as well as pathologist scoring reproducibility. To address this idea, we employed a standardized assay system and automated scoring using digital image analysis to assess either whole tumor (WT) IHC expression values or Ki67 heterogeneity (Ki67H) quantification. The goals were to 1) establish a prognostic model based on and potentially improving the IHC4 concept and 2) improve pathologist scoring reproducibility. Material and Methods: A paraffin-embedded whole tissue cohort consisting of 120 cases of hormone-positive, HER2-negative, stage I and II, breast cancer patient samples were re-stained with standardized ER, PR, HER2, and Ki67 IHC assays. Three pathologists independently scored conventional glass slides microscopically (CM) and annotated WT on H&E and Ki67 heterogeneous regions on whole slide scanned images (WSI) for each case separately. The annotations were separately registered across serial stained slides and also scored via the digital pathology algorithm. Results: The mean patient age at the time of diagnosis is 63 years with a maximum follow-up of 18 years. Patients with regional and/or distal recurrence compose 26% of the cohort with a median recurrence free survival of 8.5 years. years. Clinical variables (CV) plus WT (C-index 0.74, r2 0.38) or Ki67H (C-index 0.77, r2 0.39) models improved on patient prognostication each as compared to the IHC4 plus CV (C-index 0.70, r2 0.19) in this cohort. High inter-pathologist reproducibility for the IHC score, as measured by concordance correlation coefficient was noted for Ki67H (0.90). Conclusions: Novel algorithmic scoring methodologies such as WT and Ki67H may improve on the IHC4 concept with high inter-pathology reproducibility. We are currently validating in a larger 600 patient cohort. Citation Format: Barnes M, Srinivas C, Xu C, Dean S, Singh S, Henricksen LA, Wik N, Morris D, Magliocco A, LaFleur B. Early stage breast cancer prognostication using whole tumor or Ki67 heterogeneity-based digital imaging. [abstract]. In: Proceedings of the Thirty-Eighth Annual CTRC-AACR San Antonio Breast Cancer Symposium: 2015 Dec 8-12; San Antonio, TX. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(4 Suppl):Abstract nr P1-01-04.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».