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Enregistrement W2397576009 · doi:10.1007/978-1-61779-289-2_14

Atomic Force Microscopy and High-Content Analysis: Two Innovative Technologies for Dissecting the Relationship Between Epithelial–Mesenchymal Transition-Related Morphological and Structural Alterations and Cell Mechanical Properties

2011· article· en· W2397576009 sur OpenAlexaff
Stephen T. Buckley, Anthony M. Davies, Carsten Ehrhardt

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensTrinity College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtomic force microscopyMesenchymal stem cellNanotechnologyMicroscopyMaterials scienceTransition (genetics)Cell biologyChemistryBiophysicsBiologyPathologyMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epithelial-mesenchymal transition (EMT) is a complex series of cellular reprogramming events culminating in striking alterations in morphology towards an invasive mesenchymal phenotype. Increasingly, evidence suggests that EMT exerts a pivotal role in pathophysiological situations including fibrosis and cancer. Core to these dynamical changes in cellular polarity and plasticity is discrete modifications in cytoskeletal structure. In particular, newly established actin-stress fibres supplant a preceding system of highly organised cortical actin. Although cumulative studies have contributed to elucidation of the detailed signalling pathways that underpin this elaborate molecular process, there remains a deficiency regarding its precise contribution to cellular biomechanics. The advent of atomic force microscopy (AFM) and high-content analysis (HCA) provides two innovative technologies for dissecting the relationship between EMT-related morphological and structural alterations and cell mechanical properties. AFM permits acquisition of high resolution topographical images and detailed analysis of cellular viscoelasticity while HCA facilitates a comprehensive and perspicacious assessment of morphological changes. In combination, they offer the possibility of novel insights into the dynamic traits of transitioning cells. Herein, a detailed protocol describing AFM and HCA techniques for evaluation of transforming growth factor-β1-induced EMT of alveolar epithelial cells is provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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