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Enregistrement W2398326857

[CagA status and virulence of Helicobacter pylori strains. Results of a French multicentric prospective study].

2001· article· en· W2398326857 sur OpenAlexaff
Gilles Bommelaer, Bruley des Varannes S, Fléjou Jf, Tamara Matysiak, Thierry Poynard, A. Slama, Françis Mégraud

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensHotel Dieu Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCagAHelicobacter pyloriMedicineVirulenceGastritisGastroenterologyInternal medicineProspective cohort studyEpidemiologyAntrumSpirillaceaeStomachBiologyGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Previous experimental and epidemiological studies with few patients suggested that the presence of the cagA gene was a virulence factor for Helicobacter pylori (H. pylori). AIM: To establish in this large epidemiological cohort study the relationship between the histological virulence of H. pylori infection and the cagA status of the bacteria. METHODS: This prospective cohort study (6 month follow-up) was conducted on adult patients undergoing endoscopy for upper gastrointestinal symptoms. The cagA status of H. pylori-positive patients was established using the polymerase chain reaction (PCR) method on an antral biopsy. A score of histological virulence (inflammation, activity) was recorded on the basis of the Sydney system (on antral, angular and fundic biopsies). Eradication treatment given was not imposed and a clinical follow-up was performed at 3 and 6 months. H. pylori eradication was verified by a 13C urea breath test at 3 months. RESULTS: Four hundred and twenty two centers recruited 652 patients (mean age: 51 +/- 15 years, 55% female). Upper GI endoscopy was abnormal in 80% of the patients of whom 68% had a gastritis aspect; 38% were infected by H. pylori, and among them 51% were cagA-positive. The histological virulence scores associated with the cagA-positive strains were significantly higher than those associated with the cagA-negative strains, globally (P = 0.0035), in the antrum (P = 0.0063), and in the angulus (P = 0.046), but not in the fundus (P = 0.05). The cagA status was correlated neither with the symptom severity at inclusion and at 6 months (P > 0.05), nor with the H. pylori eradication rate at 3 months (75% in cagA-positive and 70% in cagA-negative strains, P = 0.52). CONCLUSION: This study on a large cohort of patients confirms the greater histological virulence of H. pylori cagA-positive strains. However, this virulence was not associated with more severe symptoms nor with an increase in resistance to H. pylori eradication treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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