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Enregistrement W2399581150 · doi:10.1158/1538-7445.nonrna15-a17

Abstract A17: A lincRNA orchestrates glioma stem cell-mediated angiogenesis in glioblastoma

2016· article· en· W2399581150 sur OpenAlexaff
Jenny Jing Wang, Megan Wu, Christopher Li, Uswa Shahzad, Jason Karamchandani, P. A. Marsden, Sunit Das

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalMcGill UniversityUniversity of TorontoSickKids FoundationMontreal Neurological Institute and HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAngiogenesisGliomaBiologyCancer researchPericyteStem cellCancerCancer stem cellProgenitor cellEndothelial stem cellCell biologyGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Angiogenesis is a hallmark of glioblastoma. Recent data suggest that glioma stem cells (GSCs) contribute to pathologic angiogenesis through transdifferentiation into endothelial cells or vascular pericytes. Using an unbiased screen, we identified a lincRNA near the VEGFR1 gene, which we named LIVE (lincRNA-VEGFR1), that directs physiologic vascular network formation through global effects on gene expression. LIVE is highly expressed in glioblastoma and enriched in GSCs. Over-expression of LIVE results in specification of GSCs along a vascular lineage. LIVE associates with PARP1 in GSCs and RNA helicase A in endothelial cells to drive pericyte-specific and endothelial-associated gene expression, respectively. Depletion of LIVE in a xenograft model of glioblastoma results in decreased microvascular density, vascular perfusion and pericyte coverage, and depletion of GSCs within the vascular niche. Our findings demonstrate a novel role for lincRNAs in the orchestration of tumour angiogenesis and reveal a therapeutic potential for targeting LIVE in glioblastoma. Citation Format: Jenny J. Wang, Megan Wu, Christopher Li, Uswa Shahzad, Jason Karamchandani, Phil Marsden, Sunit Das. A lincRNA orchestrates glioma stem cell-mediated angiogenesis in glioblastoma. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Noncoding RNAs and Cancer: Mechanisms to Medicines ; 2015 Dec 4-7; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(6 Suppl):Abstract nr A17.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,897

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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